近日，我院吕云云、李燕平、王均等教师在水产领域Top期刊《Aquaculture Reports》发表题为《Deciphering genome-wide molecular pathways for exogenous Aeromonas hydrophila infection in wide-bodied sand loach (Sinibotia reevesae)》论文。
以宽体沙鳅为研究对象，首先通过二代测序和三代高通量测序，成功组装了774 Mb、GC含量为0.393的宽体沙鳅基因组。该基因包含了49条染色体。研究团队前期发现嗜水气单胞菌感染严重影响了宽体沙鳅的健康养殖，为该物种的水产养殖带来严重危害。本研究通过不同对宽体沙鳅进行嗜水气单胞菌不同浓度的感染实验，确定了最小致死浓度。通过对不同感染时期下的样本进行重复性取样，并对皮肤进行转录组测序。在构建了优质宽体沙鳅基因组的基础上，对注释基因进行不同时间点下的比较分析。结果揭示嗜水气单胞菌在4h时，对宽体沙鳅参与免疫炎症、心肌等相关的分子通路产生重要影响。通过基因表达模块分析，表明嗜水气单胞菌感染宽体沙鳅表征恢复后仍存在潜在的分子通路抑制效果。通过本研究提示了治疗嗜水气单胞菌感染后的分子通路影响，并对治疗提供了一定的建议。
原文链接https://doi.org/10.1016/j.aqrep.2024.102033
撰写：吕云云；初审一校：徐静；复审二校：陈发军；终审三校：张楠